हमारे देश के कुछ क्षेत्र पाण्डुलिपियों से समृद्ध हैं किंतु उनमें जैसे लेह और उत्तर पूर्व में उनके अनुरक्षण के लिए अवसंरचना और जनशक्ति का अभाव है| मिशन ने राष्ट्रीय सांस्कृतिक संपदा संरक्षण शोध प्रयोगशाला (एनआरएलसी), लखनऊ के सहयोग से ऐसे स्थानों में विशेष क्षेत्र प्रयोगशालाओं का गठन किया है| इस समय 2 क्षेत्र प्रयोगशालाएं मौजूद हैं:

एनआरएलसी और मेज़बान संस्थान की भागीदारी में मिशन इन क्षेत्रों में पाण्डुलिपयों के संरक्षण के लिए वित्तीय सहायता तथा कार्मिक और विशेषज्ञता प्रदान करता है|