अंकीकरण का मुख्य उद्देश्य जितना संभव हो उतनी पाण्डुलिपियों की अंकीकृत प्रति प्राप्त करना है ताकि हमेशा के लिए खो जाने से पहले ज्ञान आधार को बचाया जा सके।अंकीकृत प्रतियों का उपयोग अभिलेखीय के साथ-साथ ज्ञान आधार के प्रसार के लिए भी किया जाएगा ।वर्तमान में एनएमएम स्वामित्व अधिकारों के मुद्दे का सामना कर रहा है, जो कि पाण्डुलिपिधारकों के साथ रहता है, इसके लिए एक समिति रिपोर्ट तैयार करने का काम कर रही है, जिसे भारत सरकार को प्रस्तुत की जाएगी ।यह मिशन लोगों के लिए अंकीकृत पाण्डुलिपियों की सामग्री को सुलभ बनाने की दिशा में काम कर रहा है।नए अंकीकरण मानक तैयार किए गए थे, जिन्हें तीसरे चरण में अंकीकरण के लिए पालन किया जाना है।अंतर्राष्ट्रीय मानकीकरण स्तर और एनआईसी, नई दिल्ली, सीआईएल, आई जी एन सीए और राष्ट्रीय अभिलेखागार, नई दिल्ली के सहयोग से पालन की जा रही नवीनतम तकनीकों पर विचार करते हुए मानक बनाए गए थे। अब तक 3,31,585 पाण्डुलिपियों के 3,16,57,821 पृष्ठों का अंकीकरण कार्य पूरा हो चुका है।

मद्रास विश्वविद्यालय, चेन्नई के सहयोग से मिशन वर्तमान में नए कैटलॉग कैटलॉगरम (एनसीसी) के मौजूदा खंडों को अंकीकृत कर रहा है। वर्ष के अंत तक परियोजना के पूरा होने की संभावना है। सामग्री को पहुँच योग्य भी बनाया जाएगा।

मिशन देश में 45 सबसे मूल्यवान और दुर्लभ पाण्डुलिपियों को अंकीकृत करने की भी योजना बना रहा है, जिन्हें विज्ञाननिधि में चुना गया है । अंकीकरण का चौथा चरण पूरा हो चुका है और पांचवां चरण प्रगति पर है। अब तक 3,16,585 पांडुलिपियों के 3,31,57,821 पृष्ठों का अंकीकरण हो चुका है।

प्रायोगिक परियोजना

Institution	View PDF	No. Mss digitized till now	No. of Pages
Orissa State Museum, Bhubaneswar, Odisha		1,749	3,49,588
Jain Manuscripts, Luknow, U.P.		180	42,951
Kutiattam Manuscripts, Kerala		340	38,260
Oriental Research Library, J&K		10,147	18,24,162
Allama Iqbal Library, J&K		365	97,648
Sri Pratap Singh Library, J&K		74	28,536
Sri Shankardeva Kalakshetra, Assam		2,286	1,58,695
Siddha Manuscripts, Chennai	--	2,069	78,506

Institution	View PDF	No. Mss digitized till now	No. of Pages
Orissa State Museum, Bhubaneswar, Odisha		6,093	14,20,666
Krishna Kanta Handique Library, Guwahati, Assam		2,091	1,56,173
Dr. Hari Singh Gaur University, Sagar, Madhya Pradesh		1,010	1,17,603
Anandashram Sanstha, Pune, Maharashtra		7,939	9,21,667
Bharat Itihas Samshodhak Mandal, Pune		4,429	6,60,730
French Institute of Pondicherry, Pondicherry, Tamil Nadu		506	1,70,629
Institute of Asian Studies, Chennai, Tamil Nadu		481	34,505
Kundakunda Jnanapeeth, Indore, Madhya Pradesh		7,506	11,56,373
Bhogilal Leherchand Institute of Indology, Delhi		22,907	10,64,900
Akhil Bharatiya Sanskrit Parishad, Lucknow, Uttar Pradesh		12,887	4,58,376
Rashtriya Sanskrit Sansthan, Allahabad		1,545	1,65,220
Himachal Academy, Simla, Himachal Pradesh	-	225	55,751
Vrindavan Research Institute, Vrindavan, Uttar Pradesh		22,375	15,61,864

Institution	View PDF	No. Mss digitized till now	No. of Pages
Bharat Itihas Samshodhak Mandal, Pune, Maharashtra		22,873	14,50,375
Anandashram Samstha, Pune, Maharashtra		6,734	3,27,484
Bhandarkar Oriental Research Institute, Maharashtra		35	22,679
Rashtriya Sanskrit Sansthan, Allahabad, Uttar Pradesh		26,129	18,00,409
Jamia Hamdard		4,029	10,49,031
VVBIS, Hosiarpur		1,500	1,14,376
Orissa State Museum , Bhubaneswar, Odisha		3,175	6,03,142
National Mission for Manuscripts, Delhi		562	1,21,329
Rajasthan Oriental Research Institute, Jodhpur, Rajasthan		4,680	3,78,266
Rajasthan Oriental Research Institute, Jaipur, Rajasthan		13,154	8,12,234
Rajasthan Oriental Research Institute, Bikaner, Rajasthan		10,673	6,02,364

Institution	View PDF	No. Mss digitized till now	No. of Pages
Rajasthan Oriental Research Institute, Bharatpur, Rajasthan		9,151	5,42,235
Rajasthan Oriental Research Institute, Bikaner, Rajasthan		6,158	3,09,502
Rajasthan Oriental Research Institute, Kota, Rajasthan		9,716	10,36,252
Rajasthan Oriental Research Institute, Udaipur, Rajasthan		3,310	2,48,047
Rajasthan Oriental Research Institute, Alwar, Rajasthan		1,957	3,01,639
Kurukshetra University, Kurukshetra, Haryana		11,442	7,33,501
Patna Museum, Patna, Bihar		856	1,71,158
Vadodara Oriental Research Institute, Vadodara, Gujarat (1st Phase)		4,881	7,71,657
Rashtriya Sanskrit Sansthan, Allahabad, Uttar Pradesh		16,382	13,32,629
Bhandarkar Oriental Research Institute, Maharashtra		7,553	10,25,646
Vadodara Oriental Research Institute, Vadodara, Gujarat (2nd Phase)		23,254	21,23,055